19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0522 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 306 aa  609  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  35.31 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  35.74 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  35.74 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  33.23 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  31.82 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  32.74 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  29.36 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  27.2 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>