17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2657 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2657  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  765    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000214903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1968  hypothetical protein  70.47 
 
 		 361 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0318887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0812  hypothetical protein  55.83 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2414  hypothetical protein  29.89 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4231  hypothetical protein  24.89 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  33.06 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  32 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.29 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.74 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.89 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0933  hypothetical protein  28.21 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.44 
 
 		 535 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  23.83 
 
 		 566 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>