174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2609 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  45.68 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.56 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  43.21 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  43.21 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.19 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  41.25 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  43.9 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  39.76 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  40.24 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  43.9 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.46 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  43.9 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  43.9 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  41.46 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  39.02 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  43.9 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  40.24 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.98 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  39.29 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.29 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.1 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  39.02 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.9 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  41.46 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  38.82 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  38.82 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.94 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.8 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.14 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>