56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2007 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2007    100 
 
 
111 bp  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0239127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
387 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  96.33 
 
 
924 bp  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  97.06 
 
 
432 bp  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    95.37 
 
 
1679 bp  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  95.37 
 
 
924 bp  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  95.37 
 
 
924 bp  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  95.37 
 
 
924 bp  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  95.37 
 
 
924 bp  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  94.5 
 
 
924 bp  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    94.44 
 
 
924 bp  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  93.58 
 
 
924 bp  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    96.74 
 
 
923 bp  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  92.66 
 
 
924 bp  153  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  92.66 
 
 
924 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  92.66 
 
 
924 bp  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1949    88.89 
 
 
609 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276274  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  89.86 
 
 
123 bp  81.8  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  93.02 
 
 
921 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  93.02 
 
 
921 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  82.8 
 
 
924 bp  58  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  86.15 
 
 
399 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  86.15 
 
 
399 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  86.15 
 
 
921 bp  58  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  87.5 
 
 
921 bp  56  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  87.5 
 
 
921 bp  56  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  87.5 
 
 
921 bp  56  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  87.5 
 
 
921 bp  56  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  87.5 
 
 
921 bp  56  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  90.7 
 
 
663 bp  54  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  94.29 
 
 
315 bp  54  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  94.12 
 
 
531 bp  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  94.12 
 
 
531 bp  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  85.71 
 
 
921 bp  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  85.71 
 
 
921 bp  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  91.18 
 
 
141 bp  44.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>