21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2719 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2719    100 
 
 		 619 bp  1227    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    95.12 
 
 		 948 bp  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  95.23 
 
 		 399 bp  636  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  89.51 
 
 		 963 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    89.51 
 
 		 985 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  89.02 
 
 		 918 bp  454  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  98.21 
 
 		 504 bp  404  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    91.71 
 
 		 687 bp  264  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  91.71 
 
 		 342 bp  264  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0629    91.71 
 
 		 873 bp  264  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0073    91.04 
 
 		 276 bp  248  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4320    91.47 
 
 		 186 bp  161  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  91.6 
 
 		 150 bp  157  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  89.76 
 
 		 225 bp  149  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1415    90.7 
 
 		 920 bp  54  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216347 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0104  hypothetical protein  90.7 
 
 		 126 bp  54  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4291  hypothetical protein  96.55 
 
 		 138 bp  50.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0821919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3138  hypothetical protein  96.55 
 
 		 138 bp  50.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.262195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3113  hypothetical protein  96.55 
 
 		 114 bp  50.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3080    96.55 
 
 		 634 bp  50.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0624  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 273 bp  48.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>