39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3080 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  99.12 
 
 
387 bp  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1086    99.71 
 
 
483 bp  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3080    100 
 
 
634 bp  1257    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  98.96 
 
 
336 bp  549  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3112  hypothetical protein  96.63 
 
 
183 bp  301  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3138  hypothetical protein  99.28 
 
 
138 bp  266  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.262195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  98.53 
 
 
228 bp  254  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4291  hypothetical protein  97.83 
 
 
138 bp  250  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0821919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3113  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 bp  216  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743327  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  85.42 
 
 
438 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  85.42 
 
 
438 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  85.42 
 
 
411 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0099    85.42 
 
 
321 bp  79.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  95.65 
 
 
1470 bp  75.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0110    80.43 
 
 
520 bp  73.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0101    84.38 
 
 
420 bp  71.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1411  hypothetical protein  100 
 
 
126 bp  69.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.397013  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0098    84.88 
 
 
707 bp  67.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0547185  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3090  hypothetical protein  84.52 
 
 
222 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.438523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0924    89.06 
 
 
288 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4922  hypothetical protein  84.52 
 
 
222 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  84.52 
 
 
315 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4297  hypothetical protein  84.81 
 
 
315 bp  61.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14768  normal  0.16498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  84.81 
 
 
315 bp  61.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  84 
 
 
342 bp  54  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2719    96.55 
 
 
619 bp  50.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3814    83.82 
 
 
555 bp  48.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0176634  normal  0.0869424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>