35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0110 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0098    99.62 
 
 
707 bp  1015    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0547185  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0110    100 
 
 
520 bp  1031    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  100 
 
 
315 bp  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 bp  617  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 bp  617  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4297  hypothetical protein  99.37 
 
 
315 bp  609  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14768  normal  0.16498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  99.37 
 
 
315 bp  609  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  99.37 
 
 
315 bp  609  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3090  hypothetical protein  99.55 
 
 
222 bp  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.438523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4922  hypothetical protein  99.1 
 
 
222 bp  424  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0101    99.07 
 
 
420 bp  198  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5045    83 
 
 
528 bp  196  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  98.98 
 
 
411 bp  186  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  98.98 
 
 
411 bp  186  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  98.98 
 
 
411 bp  186  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  98.98 
 
 
411 bp  186  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  98.98 
 
 
411 bp  186  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  98.97 
 
 
438 bp  184  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  96.94 
 
 
438 bp  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  96.94 
 
 
411 bp  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  96.94 
 
 
411 bp  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3814    94.23 
 
 
555 bp  79.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0176634  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3080    80.43 
 
 
634 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4291  hypothetical protein  82.98 
 
 
138 bp  60  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0821919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3138  hypothetical protein  82.98 
 
 
138 bp  60  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.262195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3113  hypothetical protein  88 
 
 
114 bp  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743327  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1086    81.45 
 
 
483 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  82.02 
 
 
381 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  90 
 
 
336 bp  48.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  90 
 
 
387 bp  48.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3112  hypothetical protein  90 
 
 
183 bp  48.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598323  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  93.55 
 
 
918 bp  46.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>