22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0101 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0101    100 
 
 
420 bp  833    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  98.78 
 
 
411 bp  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  97.81 
 
 
438 bp  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  97.32 
 
 
438 bp  712    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  98.78 
 
 
411 bp  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  98.54 
 
 
411 bp  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  98.78 
 
 
411 bp  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  98.3 
 
 
411 bp  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  98.3 
 
 
411 bp  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  98.78 
 
 
411 bp  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0098    98.98 
 
 
707 bp  553  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0547185  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0099    98.9 
 
 
321 bp  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0110    99.07 
 
 
520 bp  198  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1086    84.21 
 
 
483 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  84.21 
 
 
387 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  87.34 
 
 
228 bp  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  83.33 
 
 
336 bp  75.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3080    84.38 
 
 
634 bp  71.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0583    90.74 
 
 
246 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5044  transposase  91.84 
 
 
144 bp  65.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426017  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3814    84.38 
 
 
555 bp  46.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0176634  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2557    88.37 
 
 
168 bp  46.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>