24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1086 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1086    100 
 
 
483 bp  957    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3080    99.71 
 
 
634 bp  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  99.48 
 
 
387 bp  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  99.4 
 
 
336 bp  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  97.82 
 
 
228 bp  406  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3112  hypothetical protein  97.19 
 
 
183 bp  309  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  81.61 
 
 
438 bp  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  81.61 
 
 
438 bp  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0099    85.09 
 
 
321 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  85.09 
 
 
411 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0101    84.21 
 
 
420 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0098    84.88 
 
 
707 bp  67.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0547185  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2557    90.48 
 
 
168 bp  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4919  transposase  82.56 
 
 
180 bp  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145927  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  83.56 
 
 
342 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0110    81.45 
 
 
520 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5044  transposase  86.79 
 
 
144 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426017  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3814    83.82 
 
 
555 bp  48.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0176634  normal  0.0869424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>