18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3112 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3112  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  93.22 
 
 
128 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  92.86 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  72.88 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  70.27 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  70.27 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  70.27 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  67.57 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  67.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  67.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  67.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  67.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  67.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  47.06 
 
 
301 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  37.29 
 
 
245 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  37.29 
 
 
226 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  41.07 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
305 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>