19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3120 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  47.58 
 
 
335 aa  295  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  48.61 
 
 
331 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  31.46 
 
 
342 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  31.11 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  28.38 
 
 
352 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
363 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  27.79 
 
 
354 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  28.68 
 
 
377 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  27.11 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  28.17 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  27.92 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  26.07 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  30.4 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  26.16 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.05 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2396  hypothetical protein  26.5 
 
 
333 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1059  hypothetical protein  26.5 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0735999  normal  0.223268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>