22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3111 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1969  hypothetical protein  48.15 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0541344  normal  0.0914739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0917  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  49.12 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  41.82 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0323  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.60456  normal  0.0221102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  44.64 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  35.09 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  38.89 
 
 		 58 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  38.6 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  41.07 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  43.18 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  40.38 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  43.1 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  45.45 
 
 		 68 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>