37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2367 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  81.91 
 
 		 96 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  81.91 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  67.02 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  67.02 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  65.96 
 
 		 97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  51.06 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.77 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  31.82 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  31.82 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  32.58 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.23 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  30.43 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  33.75 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  31.25 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  30.43 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.5 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 100 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.72 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3109  hypothetical protein  25.29 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>