170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2980 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2980    100 
 
 		 523 bp  1037    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0192958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  99.67 
 
 		 303 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  99.34 
 
 		 303 bp  585  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  100 
 
 		 309 bp  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 306 bp  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04145  IS911 protein  98.91 
 
 		 273 bp  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  95.71 
 
 		 303 bp  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04109  hypothetical protein  98.87 
 
 		 264 bp  494  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3718  transposase IS3/IS911 family protein  98.83 
 
 		 267 bp  484  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0947  transposase InsN for insertion sequence element B  100 
 
 		 252 bp  456  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.308662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4856  IS911, transposase orfA  90.16 
 
 		 303 bp  351  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    89.44 
 
 		 1169 bp  347  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  90.11 
 
 		 369 bp  315  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  100 
 
 		 885 bp  295  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0312    100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  100 
 
 		 1140 bp  295  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  295  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  99.33 
 
 		 819 bp  287  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  99.33 
 
 		 819 bp  287  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  99.33 
 
 		 819 bp  287  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  99.33 
 
 		 819 bp  287  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  99.33 
 
 		 819 bp  287  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0192    95.3 
 
 		 774 bp  240  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0016    95.3 
 
 		 360 bp  240  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0082    94.63 
 
 		 189 bp  232  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224255  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  94.63 
 
 		 819 bp  232  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  100 
 
 		 1005 bp  184  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0091    100 
 
 		 315 bp  182  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  100 
 
 		 789 bp  182  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  100 
 
 		 174 bp  182  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2306  hypothetical protein  98.91 
 
 		 231 bp  174  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0882    95.31 
 
 		 78 bp  103  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.717587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  92.86 
 
 		 348 bp  79.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  92.86 
 
 		 348 bp  79.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  92.86 
 
 		 312 bp  79.8  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  89.39 
 
 		 306 bp  75.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  95.56 
 
 		 312 bp  73.8  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  95.56 
 
 		 312 bp  73.8  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 306 bp  71.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 306 bp  71.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 306 bp  71.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 306 bp  71.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 306 bp  71.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>