18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4880 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4880  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4394  hypothetical protein  85.43 
 
 		 154 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  36.23 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  55.88 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  52.94 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  50 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20520  hypothetical protein  51.43 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  52.94 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  52.94 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  50 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  50 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322211  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  50 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  50 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  46.34 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  47.06 
 
 		 252 aa  40.8  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  54.55 
 
 		 243 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  54.55 
 
 		 243 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>