24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4200 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  84.32 
 
 		 422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  38.76 
 
 		 787 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  34.24 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  29.76 
 
 		 438 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  36.6 
 
 		 529 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  40.56 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  34.14 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  31.21 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  37.21 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  44.9 
 
 		 595 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  29.64 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  31.9 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  30.03 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  30.71 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  33.56 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  39.62 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  36.26 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  28.71 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0458  hypothetical protein  26.47 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000295083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  33.58 
 
 		 621 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0833  hypothetical protein  21.33 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  36.36 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1365  hypothetical protein  30 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.113149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>