22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3171 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  86.67 
 
 		 106 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  58.33 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  58.33 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  58.33 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  56.44 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  57.95 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  52.69 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  72.6 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  50.98 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  52.87 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  52.13 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  45.26 
 
 		 280 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  46.59 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>