42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2046 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  523  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  82.42 
 
 
257 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  46.57 
 
 
251 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  38.31 
 
 
268 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  36.84 
 
 
259 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  38.91 
 
 
273 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  30.61 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.12 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  30.77 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  30.77 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  32.62 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  32.72 
 
 
222 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  43.09 
 
 
143 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.17 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  26.03 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  31.07 
 
 
434 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  30.51 
 
 
434 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  34.73 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  28.11 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  35.04 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  29.19 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  27.38 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  25.51 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  31.61 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  25.86 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  25.73 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  30.72 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  28.22 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.78 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  29.3 
 
 
642 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.78 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  27.56 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  29.26 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.27 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  28.82 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  31.43 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  26.63 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  22.12 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  25.13 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  29.45 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
402 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  28.77 
 
 
261 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>