21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1477 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  93.04 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  87.5 
 
 
121 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  86.49 
 
 
126 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  85.32 
 
 
129 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  80.36 
 
 
154 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  84.55 
 
 
119 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  67.92 
 
 
118 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  61.32 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  43.93 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  45.79 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  45.79 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  45.79 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  42.11 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  65.38 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  39.17 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  26.98 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  32.73 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  43.28 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  31.25 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05268  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>