30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3583 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  48.6 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  49.53 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  50.48 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  51.4 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  46.15 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  41.9 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  40 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  49.35 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  40.78 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  24.04 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  25.24 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  26.47 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  26.47 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  24.51 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  27.45 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  26.47 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  27.45 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  30.86 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  25.49 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  26.53 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  25.49 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  25.49 
 
 		 104 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  25.49 
 
 		 104 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>