20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2850 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2850  DoxX  100 
 
 		 120 aa  226  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  54.13 
 
 		 118 aa  121  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1536  DoxX family protein  46.38 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2822  DoxX family protein  44.74 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2840  DoxX family protein  44.74 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.78711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2965  DoxX family protein  46.67 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.619526  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1684  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  53.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  38.64 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1615  hypothetical protein  34.88 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1690  hypothetical protein  34.88 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  37.08 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  35.83 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  34.71 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  34.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  41.25 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  48.89 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  35.16 
 
 		 133 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>