17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2330 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  58.61 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  47.58 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  47.58 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  32.24 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  30.3 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  30.9 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  26.32 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  28.83 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  28.69 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  28.42 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  26.1 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  28.07 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  26.35 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  29.18 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  22.75 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>