78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2183 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  63.71 
 
 
264 aa  298  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  60.46 
 
 
281 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  58.02 
 
 
271 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  49.42 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  52.51 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  49.03 
 
 
275 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  49.03 
 
 
275 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  49.41 
 
 
275 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  49.41 
 
 
275 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  47.37 
 
 
280 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  52.56 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  51.16 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  45.96 
 
 
275 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  45.31 
 
 
280 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  41.04 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  41.46 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  46.22 
 
 
446 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  44.57 
 
 
278 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  46.43 
 
 
276 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  44.7 
 
 
276 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  45.79 
 
 
265 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  48 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  40.07 
 
 
546 aa  190  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  44.75 
 
 
278 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  47.33 
 
 
285 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  51.46 
 
 
246 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  47.18 
 
 
286 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  46.56 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  46.83 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  47.18 
 
 
286 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  48.84 
 
 
309 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  47.18 
 
 
286 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  44.92 
 
 
274 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  44.03 
 
 
294 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  44.07 
 
 
294 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  46.64 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  46.64 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  46.64 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  46.95 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  46.64 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  45.73 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  48.92 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  46.64 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  46.64 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  45.9 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  40.46 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  40.46 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  48.84 
 
 
284 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  46.63 
 
 
259 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  44.34 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  44.81 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  42.86 
 
 
268 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  42.86 
 
 
268 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  44.02 
 
 
274 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  46.73 
 
 
268 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  40.53 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  43.83 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  43.38 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  41.15 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  40.94 
 
 
319 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  45.33 
 
 
268 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  43.5 
 
 
219 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  43.6 
 
 
276 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  44.24 
 
 
300 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  41.23 
 
 
290 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  30.95 
 
 
270 aa  130  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  29.73 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  35.41 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  43.12 
 
 
161 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  35.89 
 
 
265 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  32.26 
 
 
267 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  30.45 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  33.68 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  28.04 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  55.56 
 
 
117 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  55.56 
 
 
117 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  54.76 
 
 
103 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>