More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1833 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1833  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
328 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.053429  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3455  alcohol dehydrogenase  68.62 
 
 
325 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.47 
 
 
324 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  54.1 
 
 
327 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  51.69 
 
 
324 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.44 
 
 
326 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.83 
 
 
326 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  53.09 
 
 
324 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
324 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.47 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  53.96 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  51.1 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  51.1 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  50.16 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  50.48 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 
326 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  51.72 
 
 
325 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  49.53 
 
 
324 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  50.48 
 
 
325 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
324 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
324 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
324 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.53 
 
 
326 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  51.42 
 
 
324 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
322 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
325 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
327 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
323 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.09 
 
 
327 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.53 
 
 
326 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
326 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.94 
 
 
324 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
326 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  49.53 
 
 
327 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.16 
 
 
325 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.84 
 
 
326 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  50.78 
 
 
325 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.37 
 
 
323 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 
325 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  50.47 
 
 
325 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
322 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.07 
 
 
324 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  48.11 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.54 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  47.02 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  48.89 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.55 
 
 
323 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 
325 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 
325 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.77 
 
 
324 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.34 
 
 
326 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.85 
 
 
323 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.46 
 
 
331 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.65 
 
 
326 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
325 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 
323 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  47.65 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.95 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.95 
 
 
327 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
327 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  48.26 
 
 
327 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.63 
 
 
328 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  45.77 
 
 
328 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
330 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.48 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.45 
 
 
328 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.02 
 
 
324 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 
324 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.06 
 
 
329 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.553295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  46.73 
 
 
326 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  46.08 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  49.06 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.77 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.73 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.73 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.73 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.73 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.04 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
324 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>