23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1640 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  9e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  47.33 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  44.96 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  30.08 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  28.24 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  34.04 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  31.78 
 
 		 212 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  27.97 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  28.03 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  29.31 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  27.73 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.2 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  28.7 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2394  hypothetical protein  28.71 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.358129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  24.62 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3815  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  32 
 
 		 138 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  26.89 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  24.14 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>