26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4403 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  95.85 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  95.85 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  95.85 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  91.2 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  90.74 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  91.2 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  91.2 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  85.05 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  84.04 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  81.48 
 
 		 216 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  81.31 
 
 		 215 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  84.26 
 
 		 217 aa  350  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  79.34 
 
 		 215 aa  341  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  76.41 
 
 		 215 aa  314  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  57.07 
 
 		 213 aa  254  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  55.61 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  54.25 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  58.06 
 
 		 189 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  45.02 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  44.5 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  45.73 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  43.26 
 
 		 236 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>