More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3262 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3262  acetolactate synthase isozyme I, large subunit  100 
 
 
581 aa  1197    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1404  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  78.82 
 
 
581 aa  945    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1121  acetolactate synthase, large subunit  44.95 
 
 
563 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.4 
 
 
562 aa  332  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.78 
 
 
548 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.6 
 
 
548 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.6 
 
 
548 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.6 
 
 
548 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.6 
 
 
548 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.11 
 
 
557 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.59 
 
 
548 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.98 
 
 
569 aa  330  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.48 
 
 
548 aa  329  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.48 
 
 
548 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.48 
 
 
548 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  36.48 
 
 
548 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  36.48 
 
 
548 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.48 
 
 
548 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.48 
 
 
548 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.3 
 
 
548 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.16 
 
 
557 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.53 
 
 
548 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.53 
 
 
548 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.87 
 
 
557 aa  323  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.4 
 
 
569 aa  321  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.24 
 
 
555 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  34.4 
 
 
578 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.58 
 
 
557 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.52 
 
 
548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.56 
 
 
555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  34.05 
 
 
562 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.64 
 
 
548 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.64 
 
 
548 aa  310  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.45 
 
 
557 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  34.04 
 
 
577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.23 
 
 
556 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.12 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.06 
 
 
556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.1 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.28 
 
 
557 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.28 
 
 
557 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.1 
 
 
557 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.1 
 
 
551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.66 
 
 
558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.28 
 
 
552 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
555 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  34.28 
 
 
605 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  33.86 
 
 
589 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  33.86 
 
 
589 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.92 
 
 
557 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.92 
 
 
557 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  34.22 
 
 
566 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.92 
 
 
557 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.14 
 
 
587 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  35.52 
 
 
556 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.18 
 
 
548 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.18 
 
 
548 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  34.22 
 
 
566 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.4 
 
 
521 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  33.51 
 
 
566 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.57 
 
 
573 aa  298  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.4 
 
 
548 aa  297  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.69 
 
 
571 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
569 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.51 
 
 
548 aa  296  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  33.51 
 
 
566 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  34.11 
 
 
554 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35 
 
 
548 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
569 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
578 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.79 
 
 
587 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
566 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  35.23 
 
 
582 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.8 
 
 
561 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
566 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04956  hypothetical acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic (Eurofung)  34.14 
 
 
687 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191741  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.97 
 
 
570 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.94 
 
 
581 aa  294  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  33.22 
 
 
569 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.57 
 
 
571 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.28 
 
 
566 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1120  acetolactate synthase catalytic subunit  33.94 
 
 
566 aa  293  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000146949  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.96 
 
 
587 aa  293  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.57 
 
 
571 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  33.51 
 
 
566 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
570 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
570 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.45 
 
 
570 aa  292  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
570 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  34.63 
 
 
562 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  34.11 
 
 
562 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.1 
 
 
581 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.1 
 
 
581 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  33.69 
 
 
566 aa  291  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  34.63 
 
 
562 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.63 
 
 
562 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  34.63 
 
 
562 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.25 
 
 
601 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  34.45 
 
 
562 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.67 
 
 
558 aa  290  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>