74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1715 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  93.44 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  91.76 
 
 		 182 aa  357  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  91.76 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  91.76 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  88.46 
 
 		 182 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  88.46 
 
 		 182 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  87.91 
 
 		 182 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  87.36 
 
 		 182 aa  340  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  73.63 
 
 		 189 aa  296  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  80.59 
 
 		 180 aa  294  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  76.3 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  78.11 
 
 		 191 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  72.32 
 
 		 188 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  69.44 
 
 		 202 aa  276  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  71.35 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  58.24 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  48.86 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  51.2 
 
 		 195 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  43.1 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  43.68 
 
 		 183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  43.53 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  41.9 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  44.03 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  39.05 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  40.74 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  41.1 
 
 		 193 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  39.88 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  40.24 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  39.87 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  40.8 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  37.14 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  38.22 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  35.67 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  38.15 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  34.91 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  37.02 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  34.91 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  36.87 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  35.09 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  35.54 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  36.9 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  35.59 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  36.31 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  34.64 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  37.8 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  35.06 
 
 		 283 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  34.46 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  35.06 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  35.06 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  38.55 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  35.12 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  35.54 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  35.54 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  36.14 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  35.54 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  34.15 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  34.76 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  36.47 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  35.33 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  34.97 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  34.88 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  35.14 
 
 		 288 aa  87.8  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  28.05 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  25.66 
 
 		 615 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5243  hypothetical protein  22.86 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>