36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0330 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  306  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  70.37 
 
 
162 aa  217  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  47.22 
 
 
160 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  47.22 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  45.45 
 
 
160 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  35.66 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11270  hypothetical protein  37.23 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0350705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  32.47 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  29.75 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  33.68 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  27.27 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  28.67 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  28.66 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  27.78 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  29.38 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  33.61 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  25.31 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  22.61 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  25.83 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  25.18 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  29.35 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  29.09 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  22.95 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  32.63 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  22.77 
 
 
200 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  28.28 
 
 
161 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>