More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0200 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0200  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  904    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.88 
 
 
429 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.78 
 
 
447 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  39.81 
 
 
458 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  39.15 
 
 
449 aa  315  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  37.85 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.47 
 
 
460 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  37.29 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  37.97 
 
 
436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  38.88 
 
 
474 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.91 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  36.93 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.3 
 
 
447 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  35.9 
 
 
492 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  37.67 
 
 
447 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.15 
 
 
459 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  35.66 
 
 
451 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  35.28 
 
 
455 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  36.72 
 
 
451 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  36.03 
 
 
429 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  37.12 
 
 
457 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  36.89 
 
 
458 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  37.41 
 
 
445 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.59 
 
 
457 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  35.57 
 
 
451 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.15 
 
 
457 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  38.17 
 
 
451 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  34.91 
 
 
454 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  34.79 
 
 
448 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  34.33 
 
 
453 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.53 
 
 
448 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.59 
 
 
455 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  34.72 
 
 
450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.6 
 
 
468 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  33.72 
 
 
449 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.6 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  34.95 
 
 
450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.6 
 
 
495 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  35.35 
 
 
454 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  36.28 
 
 
447 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  36.64 
 
 
440 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.66 
 
 
442 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.13 
 
 
439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  37.59 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.8 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  36.97 
 
 
454 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  37.21 
 
 
469 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  35.05 
 
 
434 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.03 
 
 
449 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.02 
 
 
441 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.48 
 
 
441 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.8 
 
 
450 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.26 
 
 
452 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  35.8 
 
 
448 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.24 
 
 
453 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.07 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.3 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.26 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.38 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  33.8 
 
 
450 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.32 
 
 
440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  36.49 
 
 
434 aa  272  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  34.55 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.55 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  36.57 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.28 
 
 
440 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  33.95 
 
 
446 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  32.87 
 
 
450 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  34.85 
 
 
452 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2810  putative nitrilotriacetate monooxygenase  37.39 
 
 
429 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.32 
 
 
431 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  34.32 
 
 
431 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  34.32 
 
 
431 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  34.32 
 
 
431 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  34.32 
 
 
431 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  36.09 
 
 
444 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.48 
 
 
439 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  34.69 
 
 
453 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  34.57 
 
 
450 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.49 
 
 
457 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  33.11 
 
 
455 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.5 
 
 
445 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  34.97 
 
 
455 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  34.1 
 
 
457 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  33.64 
 
 
444 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  33.64 
 
 
444 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  34.86 
 
 
442 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.29 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  35.09 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  33.94 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.65 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  33.87 
 
 
467 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  34.01 
 
 
449 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  34.63 
 
 
447 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  33.03 
 
 
451 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  34.97 
 
 
444 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  33.72 
 
 
451 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  34.25 
 
 
445 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.18 
 
 
445 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
440 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>