23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0005 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0045  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0542906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0027  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>