20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0326 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  100 
 
 		 321 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  49.5 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  55.38 
 
 		 148 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  28.62 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  37.84 
 
 		 154 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  44.26 
 
 		 143 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  27.82 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  27.3 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  29.04 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  22.9 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  29.84 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  27.21 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  27.51 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  26.54 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  29.3 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  28.15 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  34.07 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  25.34 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  34.02 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>