20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3735 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3735    100 
 
 		 579 bp  1148    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    89.05 
 
 		 1697 bp  549  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  89.57 
 
 		 1614 bp  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  89.54 
 
 		 1575 bp  529  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  94.05 
 
 		 186 bp  280  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  86.98 
 
 		 1305 bp  182  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  85.45 
 
 		 321 bp  91.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  82.28 
 
 		 450 bp  91.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4213    83.64 
 
 		 261 bp  75.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4967    93.48 
 
 		 372 bp  67.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  92.5 
 
 		 681 bp  56  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  89.13 
 
 		 1608 bp  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  100 
 
 		 1689 bp  52  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 675 bp  48.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1016  hypothetical protein  87.5 
 
 		 375 bp  48.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  91.67 
 
 		 1662 bp  48.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1581  hypothetical protein  93.75 
 
 		 213 bp  48.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  93.75 
 
 		 1623 bp  48.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3946    96.43 
 
 		 543 bp  48.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 2418 bp  48.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>