33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1044 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  98.37 
 
 		 369 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  73.2 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  32.63 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  30.62 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  26.71 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  30.85 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  32.1 
 
 		 241 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  28.88 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  29.66 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  31.25 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  25.83 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  31.52 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  23.22 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  27.7 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  32.71 
 
 		 133 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  29.41 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  29.38 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  28.35 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  32.93 
 
 		 133 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  38.53 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  28 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  27.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  23.45 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  23.39 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  32.47 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  34.55 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  27.1 
 
 		 127 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1687  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  27.93 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01430  hypothetical protein  32.03 
 
 		 232 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>