12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0962 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  99.7 
 
 		 331 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1037  hypothetical protein  31.55 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2098  hypothetical protein  28.06 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  26.54 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  26.89 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.27 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  26.05 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  24.47 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  22.9 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>