16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4296 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  91.89 
 
 		 74 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  74.32 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  47.14 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  45.71 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  36.49 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.14 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.14 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.71 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  33.78 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  37.14 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  37.84 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  32.86 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  28.57 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>