23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4055 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  66.45 
 
 		 640 aa  820    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1280    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  33.79 
 
 		 632 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  32.38 
 
 		 653 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  33.43 
 
 		 653 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  33.38 
 
 		 663 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  33.43 
 
 		 651 aa  333  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  34.51 
 
 		 656 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 659 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  33.38 
 
 		 665 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  32.4 
 
 		 1032 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  31.83 
 
 		 1032 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  30.77 
 
 		 671 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  32.54 
 
 		 631 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.91 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  32.43 
 
 		 631 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.42 
 
 		 1018 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 702 aa  201  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  32.05 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 474 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  27.95 
 
 		 474 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  27.33 
 
 		 474 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 542 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>