23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1438 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1438    100 
 
 		 457 bp  906    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  82.93 
 
 		 1014 bp  103  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  81.22 
 
 		 1200 bp  97.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  81.22 
 
 		 1200 bp  97.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    83.46 
 
 		 2705 bp  89.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    82.61 
 
 		 1039 bp  89.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  78.51 
 
 		 801 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    82.1 
 
 		 1184 bp  83.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  83.85 
 
 		 1200 bp  83.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  83.85 
 
 		 1200 bp  83.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  93.88 
 
 		 252 bp  73.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  81.21 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  81.21 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  93.88 
 
 		 252 bp  73.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  82.31 
 
 		 1200 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  85.19 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  84.71 
 
 		 444 bp  65.9  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  85.19 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  86.3 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  82.61 
 
 		 558 bp  56  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    83.12 
 
 		 715 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    86.79 
 
 		 596 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3235    86.27 
 
 		 261 bp  46.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>