17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1176 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  88 
 
 		 150 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  86.67 
 
 		 150 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  57.14 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  57.25 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  39.31 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  33.78 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  32.24 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  32.68 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  31.51 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  30.82 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  31.08 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  30.87 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  30.2 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  32.67 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  32.59 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  34.88 
 
 		 175 aa  42  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>