42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2377 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4906  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  53.33 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  58.7 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  50 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  50 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  50 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.83 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.65 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  52.17 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.9 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  56.52 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.89 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.24 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.98 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.66 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  38.18 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  53.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.18 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  53.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 86 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.56 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.56 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  41.3 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.43 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.44 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  40.38 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  41.07 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.84 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>