12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2157 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2157  CHAP  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0244  CHAP domain-containing protein  43.86 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.112542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2461  CHAP  39.67 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2738  CHAP domain-containing protein  45.26 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0862  CHAP  44.7 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363031  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  45.38 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2297  hypothetical protein  45.86 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2623  CHAP domain-containing protein  44.88 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1417  CHAP domain containing protein  46.83 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1107  CHAP  46.62 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00855141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1018  CHAP domain-containing protein  47.69 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1081  CHAP domain containing protein  42.74 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>