16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1650 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1650  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.241847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2521  hypothetical protein  26.23 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  38.52 
 
 		 820 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.61 
 
 		 725 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1069 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 4079 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  24.44 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  34.48 
 
 		 676 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 878 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 810 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>