20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2339 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2339  HNH endonuclease  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  42.48 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  29.79 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  36.76 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  34 
 
 		 105 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 438 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  36 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  40 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  34.33 
 
 		 635 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  34.33 
 
 		 635 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  32.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 80 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 80 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  32 
 
 		 92 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 634 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>