20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0449 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  100 
 
 		 366 aa  761    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  68.99 
 
 		 390 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  71.47 
 
 		 378 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  67.81 
 
 		 392 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  67.81 
 
 		 392 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  63.64 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  60.11 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  58.93 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  54.79 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  33.42 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  35.29 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  30.24 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  32.63 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  47.37 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  25.5 
 
 		 757 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  34.09 
 
 		 881 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1539  hypothetical protein  23.95 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930014  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 810 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  27.6 
 
 		 717 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  30.38 
 
 		 643 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>