86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3549 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  84.3 
 
 		 121 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  75.42 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  71.17 
 
 		 130 aa  164  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  63.64 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  63.64 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  59.29 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  52.88 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  49.53 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  56.57 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  48.28 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  50 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  46.94 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  45.33 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.33 
 
 		 354 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 		 350 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.63 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.08 
 
 		 341 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.29 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  35.29 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  32.58 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 351 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  37.5 
 
 		 334 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.91 
 
 		 350 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.91 
 
 		 350 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 		 343 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 		 360 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08710  ferredoxin, XylT  48 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  42.37 
 
 		 592 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.92 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1181  ferredoxin  43.33 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897222  normal  0.136525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.67 
 
 		 354 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.47 
 
 		 357 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.18 
 
 		 345 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.67 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.06 
 
 		 343 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.8 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  40.68 
 
 		 592 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.75 
 
 		 348 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.1 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.06 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.33 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.34 
 
 		 342 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.28 
 
 		 349 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  34.21 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  32.56 
 
 		 486 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  38.98 
 
 		 592 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32 
 
 		 346 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  38.24 
 
 		 336 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.89 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.84 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.79 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.09 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  37.5 
 
 		 343 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  29.35 
 
 		 369 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.94 
 
 		 332 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  32.89 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.95 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.18 
 
 		 338 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  25.3 
 
 		 538 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 		 346 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  35.53 
 
 		 353 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.18 
 
 		 337 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>