15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2818 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1590  Carbohydrate-selective porin OprB  84.77 
 
 		 1431 bp  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1665  Carbohydrate-selective porin OprB  85.71 
 
 		 1449 bp  948    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2951  Carbohydrate-selective porin OprB  85.71 
 
 		 1449 bp  948    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3166  Carbohydrate-selective porin OprB  93.38 
 
 		 1449 bp  1322    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  hitchhiker  0.000000000149961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2818    100 
 
 		 2774 bp  5499    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5726  hypothetical protein  85.56 
 
 		 399 bp  157  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06177  hypothetical protein  83.24 
 
 		 351 bp  117  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4951    81.28 
 
 		 3573 bp  97.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0352  carbohydrate-selective porin OprB  85.05 
 
 		 1479 bp  85.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    86.81 
 
 		 2257 bp  85.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0411  hypothetical protein  82.4 
 
 		 1500 bp  73.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6151    93.02 
 
 		 1317 bp  61.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.730235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4280  carbohydrate-selective porin OprB  88 
 
 		 1437 bp  61.9  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1595    91.11 
 
 		 2911 bp  58  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5205  hypothetical protein  92.11 
 
 		 261 bp  52  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>