24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1511 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  79.26 
 
 		 217 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  78.8 
 
 		 217 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  43.62 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  50.68 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  40.74 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  53.02 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  53.64 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  45.9 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  43.86 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  33.55 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  31.67 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  33.99 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  30.65 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  29.55 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  39.44 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  39.44 
 
 		 169 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  29.45 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>