24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1510 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  91.24 
 
 		 217 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  84.79 
 
 		 217 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  79.26 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  45.21 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  42.41 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  54.42 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  57.05 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  50.27 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  47.57 
 
 		 277 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  43.35 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  37.71 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  32.89 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  29.22 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  31.36 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  31.45 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  36.64 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  32.7 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  37.4 
 
 		 169 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  28.89 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>