24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1508 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  84.79 
 
 		 217 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  45.21 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  43.09 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  51.7 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  54.36 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  48.66 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  47.57 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  39.33 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  36.31 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  31.36 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  32.24 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  29.22 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  29.84 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  33.54 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  38.36 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  38.36 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  27.41 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>