165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3189 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 78 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  89.74 
 
 		 78 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  88.61 
 
 		 79 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  87.18 
 
 		 77 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  87.34 
 
 		 79 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  81.58 
 
 		 79 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  74.36 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  48.75 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  50.6 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  49.37 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  69.23 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  66.67 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  46.59 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  72.34 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  87.5 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  67.19 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  61.82 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  58.21 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  58.73 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  50.88 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  56 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  65.96 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  72.34 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.94 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  42.25 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  35.44 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  42.47 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  34.18 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  30.38 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  35.94 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  29.17 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  49.15 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  32.88 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.28 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  31.43 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  31.43 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  36.11 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  52.83 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  40.82 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  34.85 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1776  twin arginine translocase protein A  36.71 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  44 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  41.51 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  32.47 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  32.47 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  32.47 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  35.94 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  36 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0714  twin arginine translocase protein A  36.71 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>